关于税费的问题，业界也存在颇多争议。前不久，财新网记发布的房地产业税费增长的统计结果受到广泛关注，根据财政部和国家税务总局近十年的统计数据可以看到：这十年间，仅针对房地产业征收的五大税种，从2003年的900多亿元，上升到2012年的1.01万亿元，增长1022%。五个税种收入合计占税收收入的比重，从2003年的4.5%，提高至2012年的10.1%。
中国房地产研究会首席研究员 李战军
李：我们现在没有看到政府对房地产的费税有实质性的下降，而是年年费税在不断地提高，房地产业的费税实际上是支撑着中国财政的费税，在这个费税之外还有一块，就是土地出让金，每年大体上3万亿的土地出让金这个流入到政府的口袋，所以，费税不减怎么能够评议房价。
顾云昌提出，当前紧要的不是继续加征税费，而是要对不合理的税制进行结构性调整。
顾：结构的不合理和总量的这个过多，我认为是房地产税收的一个问题。那么结构的问题就是说，我们主要是在保有环节没有税收，所以导致很多的持有房产投机投资，那么在开发环节的税费混杂，流通环节的税率很高，这样导致了流通也不畅，开发环节混杂这些行为，而持有环节不足。所以房地产税收体制改革势在必行。所以说体制改革，我想除了不应该在总量上增加税负以外，因为终的税终都是老百姓承受的，开发商的中间过一下。总量上绝对不能增加的，要理顺这个税收的结构，我认为这是下一步房地产税收体制改革的重点。
新国五条一出，就引发了市场极大的震动，假离婚，假合同，各种对策层出不穷。而其中二手房个税20%的方案，更是产生了立竿见影的结果，一些刚性需求，从二手房市场转移到了新房市场，一下子拉高了新房市场的温度。有刚需的购房者担心的是，如果房价上涨的大势不变，那么这20%税费就会是买房者承担。因为经济学基本原理告诉我们，供求关系决定价格。现在我们还无法确定，政策具体实施后对房地产市场的长期影响，但是，就目前的短期效应来看，新房房价被迅速推高，租房市场也水涨船高，我们暂时还没有看到消费者从中获益。其实无论是什么样的手段，市场终会遵循着它自身的规律起伏涨跌。我们希望看到，在新国五条从发布到具体落实的过程中，相关部门能够实事求是制定符合政策初衷的明确细则。
